Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Nhlrc3Q8CCH2 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms