Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp20Q8C6M1 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms