Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pcsk9Q80W65 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms