Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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Usp49Q6P9L4 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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Usp49Q6P9L4 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Usp49Q6P9L4 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Usp49Q6P9L4 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Usp49Q6P9L4 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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Usp49Q6P9L4 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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