Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
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