Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trafd1Q3UDK1 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms