Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
SbdsP70122 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SbdsP70122 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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