Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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Sh3bp1P55194 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms