Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
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PtprmP28828 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
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PtprmP28828 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
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PtprmP28828 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Plec-209ENSMUST00000089610 14972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
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