Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms