Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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Ggta1P23336 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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Ggta1P23336 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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Ggta1P23336 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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Ggta1P23336 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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Ggta1P23336 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms