Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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