Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms