Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Zzz3-203ENSMUST00000106101 7539 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Usp9yF8VPU6 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms