Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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