Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Specc1-207ENSMUST00000201364 4955 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Col5a3Q9JLI2 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms