Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OtofQ9ESF1 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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