Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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