Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Hoxa13Q62424 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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Hoxa13Q62424 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxa13Q62424 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms