Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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