Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Snx27Q3UHD6 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms