Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Traf3ip1Q149C2 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Traf3ip1Q149C2 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Traf3ip1Q149C2 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Traf3ip1Q149C2 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms