Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Mc1rQ01727 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms