Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms