Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
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Sh3bp1P55194 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Sh3bp1P55194 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Sh3bp1P55194 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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Sh3bp1P55194 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Sh3bp1P55194 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Sh3bp1P55194 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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