Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms