Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms