Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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