Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms