Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Entpd5-201ENSMUST00000021662 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-214ENSMUST00000111688 6146 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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