Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Hpf1Q8CFE2 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hpf1Q8CFE2 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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