Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms