Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms