Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cnn1Q08091 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cnn1Q08091 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cnn1Q08091 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cnn1Q08091 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cnn1Q08091 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cnn1Q08091 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cnn1Q08091 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cnn1Q08091 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cnn1Q08091 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cnn1Q08091 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cnn1Q08091 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cnn1Q08091 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cnn1Q08091 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms