Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sox12Q04890 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sox12Q04890 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sox12Q04890 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sox12Q04890 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sox12Q04890 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sox12Q04890 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sox12Q04890 Gm43910-201ENSMUST00000204561 3241 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sox12Q04890 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Sox12Q04890 Adgrg1-201ENSMUST00000093271 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Sox12Q04890 Tlr5-201ENSMUST00000110997 3199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gpatch2-206ENSMUST00000160471 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Rreb1-201ENSMUST00000037232 8395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Ap3b2-201ENSMUST00000082090 3804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Mir185-201ENSMUST00000083530 65 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Atp6ap2-201ENSMUST00000033313 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gpkow-201ENSMUST00000049896 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Arhgap19-202ENSMUST00000163265 5058 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Cpeb1os1-201ENSMUST00000207156 2112 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Ston1-207ENSMUST00000163588 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Idi2-201ENSMUST00000038598 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 4831440D22Rik-201ENSMUST00000211287 2929 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Pla2g2c-202ENSMUST00000105808 3448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 D630039A03Rik-201ENSMUST00000063816 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm26929-201ENSMUST00000182703 753 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Panx3-201ENSMUST00000011262 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm17359-203ENSMUST00000199658 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Cyp2c37-201ENSMUST00000049178 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Rpgr-205ENSMUST00000115533 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sox12Q04890 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms