Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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