Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Ercc6-201ENSMUST00000066807 8423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr161-202ENSMUST00000216259 7133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 BC048644-201ENSMUST00000140928 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd8P23463 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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