Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms