Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm28048F7BCN0 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms