Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Snx8Q8CFD4 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms