Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Ccdc88cQ6VGS5 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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