Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Snx27Q3UHD6 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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