Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Pkp1P97350 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms