Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Tma16-201ENSMUST00000026681 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Prim1P20664 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Prim1P20664 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms