Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Ccl20O89093 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ccl20O89093 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ccl20O89093 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ccl20O89093 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ccl20O89093 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ccl20O89093 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ccl20O89093 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Ccl20O89093 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Ccl20O89093 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Ccl20O89093 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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