Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ptpn9O35239 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ptpn9O35239 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ptpn9O35239 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ptpn9O35239 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ptpn9O35239 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ptpn9O35239 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ptpn9O35239 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Ptpn9O35239 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Ptpn9O35239 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Ptpn9O35239 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Ptpn9O35239 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Ptpn9O35239 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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Ptpn9O35239 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ptpn9O35239 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms