Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.4 ms