Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms