Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
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Gtf3c6Q9D8P7 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
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Gtf3c6Q9D8P7 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Gtf3c6Q9D8P7 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Gtf3c6Q9D8P7 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Gtf3c6Q9D8P7 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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Gtf3c6Q9D8P7 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Gtf3c6Q9D8P7 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Gtf3c6Q9D8P7 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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