Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg16l1Q8C0J2 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms